Universitas Islam Sultan Agung (UNISSULA) didirikan oleh Yayasan Badan Wakaf Sultan Agung (YBWSA) pada 20 Mei 1962, bertepatan dengan 16 Dzulhijjah 1381 Hijriah. Nama Sultan Agung diambil dari gelar Adi Prabu Hanyokrokusumo, sebagai bentuk penghormatan terhadap nilai-nilai kepemimpinan dan perjuangan.

Sejak awal berdirinya, UNISSULA berkomitmen menyelenggarakan pendidikan tinggi yang mengintegrasikan ilmu pengetahuan dan nilai-nilai Islam. Komitmen tersebut menjadi landasan bagi pengembangan berbagai program pendidikan, termasuk pendidikan di bidang farmasi dan kesehatan.

Perjalanan pendidikan farmasi di UNISSULA dimulai dengan berdirinya Program Studi Sarjana Farmasi pada 21 September 2011. Program studi ini berada di bawah naungan Fakultas Kedokteran.

Pendirian program studi ini menjadi langkah awal UNISSULA dalam mengembangkan pendidikan kefarmasian yang berorientasi pada penguasaan ilmu pengetahuan, keterampilan profesional, serta pembentukan karakter lulusan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.

Sebagai pengembangan pendidikan kefarmasian, UNISSULA mendirikan Program Studi Pendidikan Profesi Apoteker pada 30 September 2019.

Kehadiran program pendidikan profesi ini melengkapi jenjang pendidikan farmasi, sekaligus memperkuat komitmen UNISSULA dalam menyiapkan calon apoteker yang memiliki kompetensi profesional, menjunjung etika, dan mampu memberikan pelayanan kefarmasian kepada masyarakat.

Seiring dengan perkembangan pendidikan dan kebutuhan pengelolaan akademik, Fakultas Farmasi UNISSULA resmi berdiri sebagai fakultas tersendiri pada 30 Agustus 2023.

Pembentukan fakultas ini menandai babak baru dalam pengembangan pendidikan farmasi di UNISSULA. Dengan pengelolaan yang lebih mandiri, Fakultas Farmasi terus memperkuat kualitas pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat di bidang kefarmasian.

Pada 15 Desember 2023, Program Studi Sarjana Kebidanan dan Pendidikan Profesi Bidan resmi bergabung dengan Fakultas Farmasi.

Bergabungnya kedua program studi tersebut memperluas cakupan keilmuan dan pengembangan akademik Fakultas Farmasi. Hal ini juga menjadi bagian dari upaya memperkuat kontribusi fakultas dalam bidang pendidikan kesehatan.

Pada tahun 2024, Program Studi Sarjana Farmasi dan Pendidikan Profesi Apoteker berhasil memperoleh predikat akreditasi Unggul dari LAM-PTKes. Pencapaian ini menjadi salah satu tonggak penting dalam perjalanan Fakultas Farmasi UNISSULA.

Predikat tersebut merupakan hasil dari komitmen dalam meningkatkan mutu pendidikan, tata kelola program studi, kualitas sumber daya manusia, serta pelaksanaan tridarma perguruan tinggi. Capaian ini sekaligus menjadi motivasi untuk terus mengembangkan pendidikan kefarmasian yang berkualitas dan berorientasi pada kebutuhan masyarakat.